Teoricamente não tem risco nenhum.
Mas isso é, teoricamente.
Algumas coisas podem ser pendentes, tipo:
Você tem muitos PPA instalados no Ubuntu?
Você tem muitos programas externos aos repositórios instalados no Ubuntu?
Se a resposta é não, então tem 99,99% de chances de dar certo.
Agora, sempre é altamente recomendado fazer um back-up prévio dos seus arquivos (e das pastas ocultas .mozilla e .thunderbird, com as configurações do Firefox e do gerenciador de email Thunderbird) para em eventual erro não se desesperar.