5- Não consigo configurar os ícones da minha área de trabalho. Os ícones no ubuntu ficam grandes demais, e é muito limitada as modificações que se pode fazer com o tamanho dos ícones. (Gosto de utilizar 1 trilhão de ícones no desktop)
6- Dificuldade pra instalar programas. Pra instalar qualquer coisa você tem que descompactar, compilar e instalar. Pode ser moleza pra quem usa Linux há algum tempo, mas pra cativar os usuários Windows a migrarem pro Linux, tem que ter um jeito mais fácil. (Os pacotes Deb são uma boa, mas é raro encontra-los).
7- Pra deixar o Linux redondinho pra abrir todas as páginas da internet tem que rebolar muito!!! Pegar 1 trilhão e meio de plugins, instalá-los, atualizar Mplayer, etc.... Junta ainda com a dificuldade de se instalar programas no Linux.
8- Dificuldade pra desinstalar os programas. Se você instala alguma coisa que não seja do repositório, não existe nenhum uninstall pra eles..Só fazendo na unha..... (No windows todos os softwares vêm com o ícone de Unistall)
5: não entendo qual a limitaçao que você encontrou para o tamanho dos ícones, você pode alterá-lo facilmente, quem faz isso é o nautilus. Além do mais, clickando com o botão direito no ícone, você vai ver a opção "esticar ícone" e poderá deixa-lo do tamanho que quiser (isto no gnome).
6: raramente hoje em dia você realmente precisa compilar alguma coisa. E quando tem que, geralmente é o básico "./configre", "make" e "make install" que não é la o bixo de se fazer (o problema são as dependências).
7: não concordo que você tenha instalado "um milhão de plugins". Aqui, a única coisa que precisei fazer foi instalar o flash, e ajeitar para que os streamings de vídeo sejam executados pelo mplayer. Garanto que você não fez muita coisa a mais do que isso.
8: quando você compila um programa, usando o "make install", você pode ir na pasta onde esta o código fonte e dar um "make uninstall" que ele vai desinstalar o programa.
São apenas algumas observações, para que você não fique com uma impressão errada do linux (em especial do Ubuntu) e consiga se afastar cada vez mais do Micro$oft Ruindows.