Então, /Elisandro/, alguma evolução nessa questão?
Esse assunto é muito importante para ficar esquecido.
Continua parecendo que a questão não está de fato resolvida, que o problema permanece como posto inicialmente no outro tópico (114901.0).
"Windows hibernation and fast restarting
On computers which can be dual-booted into Windows or Linux, Windows has to be fully shut down before booting into Linux, otherwise the NTFS file systems on internal disks may be left in an inconsistent state and changes made by Linux may be ignored by Windows.
So, Windows may not be left in hibernation when starting Linux, in order to avoid inconsistencies. Moreover, the fast restart feature available on recent Windows systems has to be disabled."
Isso e o quanto abaixo está no contexto: "Missing, disappeared files or directories?", que parece ser o seu caso.
Vejo que há uma orientação para, **no Windows, como administrador**, executar o seguinte comando:
powercfg /h off
Tem mais um detalhe que parece se aplica ao seu caso, disco SSD, porém no momento me escapa o real alcance disso:
If your computer has a SSD plugged in, it might be used by Windows as a cache controlled either by the hardware (“Intel Fast Response Technology”) or by software (“Expresscache”, “ReadyCache”, etc.). This feature is generally not compatible with both Windows and Linux and you may have to disable it.
Se o caso, como é que faz para desabilitar essa função de cache no Windows? Não sei dizer.