Ele fica travado nesta tela?
[ OK ]
Installing Flash Player 9
Extracting files
Installing flash on ie6
Aqui também não baixou e eu apertei Ctrl+D. Aí ele termina a instalação, mas sem flash =/
A propósito, execute o ./ies4linux como usuário normal, dentro de uma pasta no seu home (pelo seu primeiro erro você tá fazendo isso pelo root).