Francis Ricardo, deu tudo errado aí pq acho q vc usou o mesmo nome de usuário para todas as distros. Aí as configurações de cada uma se conflitam, cada distro tem um desktop diferente, e mesmo que sejam iguais (duas distros com Unity, por exemplo), é possível acontecer algum problema. É bem o que zekkerj falou.
Se você tiver o cuidado de criar os mesmos usuários com os mesmos nomes na mesma ordem, de forma que eles recebam os mesmos UIDs, pode funcionar. Mas esteja preparado para ter problemas com aplicativos instalados em versões diferentes em cada sistema, pois eles podem criar configurações conflitantes.
Eu sei disso porque já cai na besteira de colocar mesmo nome de usuário em distros diferentes, quando estava aprendendo a mexer em Linux.
A solução é apagar todas pastas e arquivos ocultos da pasta do seu usuário, depois entrar somente em uma distro, e criar um outro usuário por lá, e aí apaga tudo de novo, entra no outro usuário, e apaga o original (para isso é necessário dar poder de sudo para esse usuário novo). Acho que o melhor a fazer é entrar na conta de root e criar um outro usuário, e excluir o original, é mais fácil. Na hora de deletar, irá perguntar se vc quer apagar a pasta, escolha não, pois essa pasta é importante para a outra distro.
Agora q vi a imagem, bem ilustrativa Creto.