1 - Uso linux bem uns 6 anos e nunca fui infectado por vírus ou coisa equivalente. Dizer que não existe é mito, mas na sua grande maioria são vírus conceituais que estão atrelados a muitos "se" (se o usuário fizer isso... se o usuário fizer aquilo....). No final é como cabeça de bacalhau, todo mudo sabe que existe, mas (quase) ninguém viu. Quanto ao firewall exite o ufw que por padrão está desabilitado, mas basta habilitá-lo que no fórum mostra como. Tem também uma interface gráfica para ele chamada de Gufw. Antivírus até tem o clamav nos repositórios, mas muitos dos antivírus para windows possuem versões para linux, entretanto isso não é necessário no linux.
2 - Sim no Ubuntu o Libreoffice já vem instalado e na versão 13.10 do Ubuntu a versão dele é a 4.1.2.3
3 - O falsh palyer é instalado com a instalação do pacote ubuntu-restricted-extras caso no momento da instalação do sistema você não tenha marcado umas opções que falam em codecs multimídia. Para que a instalação não demore muito por padrão essas opções vêm desmarcadas no instalador cabendo você marcar ou não para instalar no momento da instalação do sistema, mas é preciso ter conexão com a internet. Eu prefiro instalar depois pelo pacote já comentado. Quanto ao AdobeReader até a versão 13.04 era possível instalar pelos repositórios "parceiros" do Ubuntu o pacote acroread. Nessa ultima versão não vi mais esse pacote disponível, entretanto todos os navegadores leem pdf e no Ubuntu tem um leitor de pdf padrão. Agora se fizer questão do reader da Adobe, acho que no seu site tem versão para linux também. Ainda sobre o flash o instalado pelo ubuntu-restricted-extras é de uma versão mais antiga que a do windows porque a adobe não disponibiliza mais as versões mais recentes para o linux, entretanto o navegador chrome tem embutido nele o flash mais recente, não precisando desse pacote ubuntu-restricted-extras. O flash deste pacote é mais para os outros navegadores (Firefox, Opera, etc.) e apesar de versão inferior, funciona bem também.
4 - O Ubuntu tem o player de vídeo padrão chamado totem, mas nada impede de você instalar dos repositórios o vlc, mplayer ou outros que existam. Lembro mais uma vez que é necessário instalar o pacote ubuntu-restricted-extras para instalar codec multimídia.