O problema da personalização não é que o pessoal queira mudar todo o sistema e deixar a empresa uma salada de frutas. O problema da personalização é que as pessoas querem personalizar para deixar o fluxo de trabalho o melhor possível para elas. Por exemplo, muitas pessoas gostam de usar clique simples para executar arquivos, embora a maioria goste de usar cliques duplos. Muitas pessoas gostam de usar o foco seguindo o mouse, enquanto a maior parte da população prefere foco no clique.
No Windows XP, que eu uso no escritório onde trabalho, eu posso escolher entre ter ou não ícones no desktop, atalhos para lançadores na barra de tarefas, e o menu iniciar clássico ou duplo, por exemplo. E mesmo assim ninguém reclama que o WIndows é muito personalizável (até porque ele não é). Os exemplos que eu dei não são os únicos, e eu nem trabalhei tanto com o Unity para saber se ele tem essas opções ou não, porque o problema que eu tive com ele foi no meu fluxo de trabalho, que não se adaptou ao Unity, e eu não consegui mudar para um que se adaptasse (e também não corri muito atrás, porque o Gnome SHell caiu como uma luva).
Eu posso dizer, por exemplo, uma das coisas do Unity com as quais eu não me adaptei: Logo que eu reinstalei meu SO, eu comecei a restaurar meu backup e fazer outras coisinhas a mais. Para restaurar minhas músicas ao mesmo tempo em que eu organizava elas e fechava os buracos faltando nos meus álbuns, eu tinha 3 janelas do Nautilus abertas. Cada janela que eu abria ficava "escondida" atrás do ícone do Nautilus no launcher, e aí, cada vez que eu tentava achar a janela que eu queria (entre as minhas várias janelas), era um parto, porque quando eu clicava no ícone do Nautilus (que tem tanto a função de "quick launch" quanto de "barra de tarefas" para as janelas do Nautilus) ele nunca abria a janela que eu queria. Usar Alt+Tab também era incômodo, porque eu tinha várias janelas abertas, e na janela do alt+tab só aparecia "Nautilus" escrito, assim eu tinha que ir chutando até achar a janela que eu queria. E eu não achei uma opção para mudar isso. Até o XP tem uma opção para não agrupar as janelas semelhantes na barra de tarefas.
No Gnome Shell, eu fui fazer a mesma coisa, mas levei 10x menos tempo (principalmente porque o Gnome Shell é muito mais responsivo do que o Unity). Cada vez que eu queria mudar de janela, se ela já não estivesse a vista, era só apertar a tecla Super e todas as minhas janelas apareciam como se fosse o Exposé do MacOS, aí era só clicar na janela desejada. Trocentas vezes mais fácil.
Outra coisa: No Unity, perdi a conta de quantas vezes eu fui tentar clicar em algum link/ícone ou selecionar alguma coisa próxima ao lado esquerdo da tela, e aí a porcaria do launcher aparece e me faz abrir algum programa que eu não queria abrir. No Gnome Shell, o launcher só aparece quando eu quero (clicando em "Atividades" no canto superior esquerdo ou apertando "Super").
Eu não estou dizendo que o Gnome Shell é melhor ou mais customizável que o Unity (que diabos. O Gnome Shell não é mais customizável, mas é bem melhor), só que o Gnome Shell se adequou melhor ao meu fluxo de trabalho, e o Unity tem algumas atitudes das quais eu não gosto, e que eu não pude mudar, e é esse o ponto do "personalizável" que todo mundo toca.