Entao, funciona assim pelo que eu me lembro! vc exclui ou renomeia o monitor.xml, reinicia o pc, e faz uma nova configuração la em monitores e deixa como que quer ai sim ele cria o novo monitor.xml. Se vc so reiniciar e nao mexer ele nao cria, ele so cria depois que vc acessar a aba monitores e fazer alguma alteração, dai sim ele cria um novo arquivo monitor.xml, vc tambem pode conectar o outro monitor apos excluir o arquivo assim no proximo boot com o monitor conectado, ele ja cria o arquivo contendo a referencia aos dois monitores. Se vc quiser tbm faz uma copia e deixa guardado desse arquivo, nunca se sabe ne?
Outra coisa que é de se pesar e a troca da placa de video, intel quando vc precisa economia de bateria e a dedicada nvidia quando precisa de performance para games,, vc tem que ver se com o driver livre, o nouveau, ele gerencia bem a troca das placas.
tem um applet que se eu nao estiver enganado se chama "prime indicator" que fica na barra de cima, dai e so dar um clique ele ja muda de placa, talvez sendo necessario um logoff ou nao...
Vc pode testar a troca das placas com o driver proprietario, para ver se funciona bem.
Verifique tbm a temperatura se esta tudo ok!