Que é isso, cada um tem seus compromissos, eu mesmo não lembro de entrar todo dia. Se não fosse o aviso de postagem por e-mail, eu não lembraria de ver o seu caso.
Quanto ao risco de parar de funcionar, não vejo isso tão cedo. Vai ser mais como se você tivesse pulado alguma atualização.
Não consegui ver uma indicação clara de problema na saída dos comandos que você postou. Talvez uma estratégia que a gente possa adotar seja esperar a próxima atualização da biblioteca problemática (gconf2-common) e ver se essa atualização sana o problema. O que você acha, @creto?