Instale no Windows uma ferramenta chamada HDD Low Level Format e formate seu pendrive..!
Só para agregar informação, formatação de baixo nivel (Low Level format) já não funciona mais em HD's que possuem S.M.A.R.T. ( 100% deles hoje em dia).
HD muuuito antigos, os MFM, cujos braços oscilatórios eram comandados por molas (usei muitos, o meu primeiro tinha 4 MB, um assombro na época), exigiam formatação de baixo nivel.
Os modernos, com correções de spin e gravação do estado do S.M.A.R.T., se fizer um Low level format, ele irá ser mostrado em sua tela, e ao reiniar o hd, no primeiro spin tudo é removido pelo firmware.
Não é possivel se sobrescrever o firmware de HD's modernos e atuais sem remover a placa logica e utilizar programas para tal finalidade.
Assim, uma formatação de baixo nível só é feita na fabrica, durante a montagem de um HD.
Veja aqui a descrição de um fabricante informando esta impossibilidade =>
http://knowledge.seagate.com/articles/en_US/FAQ/203931enWhat does "low level format" a SATA or ATA (IDE) drive mean?
Actually the term "low level" is a bit of a misnomer. The low-level process first used years ago in MFM hard drives bears little resemblance to what we now call a "low-level format" for today's SATA and ATA (IDE) drives. The only safe method of initializing all the data on a Seagate device is the zero fill erase option in SeaTools for DOS. This is a simple process of writing all zeros (0's) to the entire hard disk drive.
Tradução livre e com observações de minha auoria: Na verdade o termo "low level" é um pouco fora de propósito. O processo de baixo nível utilizado anos atás ( uns 20 anos) em discos MFM tem pouca semelhança com o que é chamado como "low-level format" nos atualis driscos SATA e ATA. O unico método seguro de remover qualquer dado em dispositivos Seagate ( e qualquer HD moderno de qualquer fabricante) é utilizar a opção "zero fill erase" (que seja, preencher todas as trilhas de um hd com zero).
Como visto, preencher o HD com zero de informação ( HD são gravados e lidos em codigo binário de zero/um) não é uma formatação de baixo nivel, mas tão sómente uma forma de se remover informação dentro de um hd por segurança.
Segurança esta, bem relativa, pois durante o processo de leitura/escrita de um HD, flutuações nas cabeças de leitura/gravação podem ainda reter dados, mesmo preenchendo o hd com zero ou um.
Existem relatos na rede que o Departamento de Defesa dos EUA possuem softwares que recuperam informações de HD's preenchidos mais de cinco vezes com zero ou um.
[]'s