Para criar atalho da pasta pessoal na área de trabalho, dê um "alt + F2" digite "gconf-editor", na tela que abre, entre em "apps - nautilus - desktop" e marque a opção "home-icon-visible". Vc pode também deixar visivel as opções lixeira (trash), rede (network), meu computador (computer) e suas partições (volumes-visible), só que essa última mostra no seu desktop qualquer volume montado, HD, pendrive, mp3, etc...
Agora qto a excluir da lixeira, não entendi bem. Vc escluiu a pasta home, é isso? Ou excluiu apenas uma cópia que fex dela?