Isso está parecendo problema não no NetworkManager, e sim no processo de suspensão/hibernação. Pode estar acontecendo que a própria interface de rede não retorna, e não no serviço do NM, como acontecia antes.
Se for mesmo esse o caso, o problema pode se manifestar também em outras áreas, como som, vídeo, etc.
Sendo mesmo essa questão, seu tópico está na área errada, deveria estar em "Sistema".