Sempre faça o backup é obrigatório para qualquer sistema Operacional.
Vá em /home/seu_nome_usuário/.thuderbird/t4gwebl8.default/imap ou pop
Cópie a pasta acima para um cd/dvd ou pendrive
Considerações:
- t4gwebl8.default (este nome de pasta varia sempre, mas deve ser algo parecido com isso)
- Imap ou pop (Varia devido a escolha de cada usuário, no meu caso escolhi imap, mas poderia ser pop)
Baixe o cd do 12.04 e atualize o sistema. Cuidado para não limpar tudo, preste atenção nas opções do boot.
Após o ubuntu ser atualizado entre no Thunderbird provavelmente todos seus e-mails estarão como antes.