Pelo menos aqui no Brasil:
- o que mais rola profissionalmente em matéria distribuição é Debian e Red Hat.
- o que mais rola para uso doméstico é Ubuntu (baseado em Debian) e Fedora (baseado em Red Hat).
Nas provas da LPI (nível 1, 2 e 3) te certifica em conhecimentos relacionados ao Debian e Red Hat.
Como base principal, todo Linux opera da mesma maneira, as particularidades mais "gritantes" ficam por conta de "controladores" como: yum, dpkg, apt, yast...