Erro no ./configure.in !

[LordAngels]

Estou tentando instalar o Kiba-Dock e não consigo.
Na verdade eu não consigo instalar quase nenhum programa pelo terminal que venha em tar.gz ou tar.bz2.
Consegui através de vários tutoriais que peguei na internet saber o que realmente tenho que fazer, que seria escrever depois de:
cd kiba-dock
o comando:
./configure.in para executar o configure.
Mas quando estou executando como root no terminal, o Bash retorna como Permissão Negada.
Está negando também o  autogen.sh.
O que eu faço?


Obs: Estou tentando fazer isso no Ubuntu.

Abraços