Olá leodg, talves você precise recuperar o boot de ambos os sistemas...
(Supondo que seja o Windows 7 + Ubuntu)
1. Coloque o dvd de instalação do Windows, entre na opção de recuperação, abra o prompt e digite:
bootsect /nt60 all /force /mbr
Saia do prompt e clique na opção de recuperar a inicialização, espere o fim do processo. Isso deve fazer o Windows iniciar sem o Grub.
2. Entre com o live-cd do Ubuntu abra o terminal e digite:
sudo mount /dev/partiçãodoubuntu /mnt
sudo grub-install --root-directory=/mnt /dev/sda
Isso recuperar o grub fazendo os dois sistemas iniciarem...
Abç.