Vc disse sobre mandar clicks para o servidor, logo pensei em mandar sinais, e o netcat faz isso de forma simples!
Agora, executar Javascript dentro do Bash nunca ouvi falar; normalmente Javacript eh executado por browser, nao? Talvez possa usar um browser em modo de texto que possa ser chamado em scripts Bashs facilmente.
O que exatamente vc deseja fazer?