Tenha sempre em mente que reinstalar um sistema, seja um Windows ou o Linux, até pode dar algum trabalho, tomar alguns minutos ou até horinhas a mais, mas sempre será possível, é apenas uma questão de um pouco a mais ou um pouco a menos de trabaho, a mesma coisa em relação a reinstalar aplicativos, entretanto, perder arquivos pessoais únicos, aí não tem jeito, aquela foto com a mãe, com a namorada, com a esposa, com os filhos, com os amigos, que só tem lá no seu computador, se perdeu, nunca mais irá recuperar, assim, os vídeos, os documentos textos autorais e coisas semlhantes, coisas únicas, essas precisam ser protegidas em backup externo, até porque um dia seu computador, como qualquer aparelho elétrico e eletrônico, pode queimar.
Em princípio de fizer tudo certo não vai perder nada, não precisa apagar nenhuma partição Windons onde estão os dados, nada irá se perder, mas sempre há o risco de fazer algo errado e ir tudo pro espaço, esse é o risco.
O Linux convive sem nenhum problema junto com o Windows em dual boot (ou trial, ou multiboot, tanto faz).
Se algo de muito errado acontecer sobretudo não sobrescreva nada, pois isso elimina qualquer chance de recuparação. Se alguma coisa der errada você deverá subir o sistema através do live-iso e usar o Testdisk para tentar recuperar seus dados.
Bem, o que poderia ser dito à respeito de backup está dito, então vamos adiante.