Para restaurar as configurações do Libre Office, basta deletar a pasta .config/libreoffice, que fica dentro da sua pasta de usuário. Ou então, pelo terminal (como usuário padrão):
rm -r ~/.config/libreoffice
Quanto à remover pacotes, precisa saber quais instalou e como fez isso. Por exemplo, se usou os repositórios oficiais, se foi PPA, um arquivo .deb, tarball, etc.
Sobre esse erro que aparece aí, você verificou o Java? Para isso, abra o Libreoffice, vá em Ferramentas, Opções, Avançado e verifique se á algum java instalado marcado pelo programa.