Saudações.
Primeiro, deve saber qual é a identificação de cada dispositivo.
Faça, no terminal:
lsblk
Ou, pode usar o programa Gparted, que irá identificar cada dispositivo e suas partições para você.
Segundo, deve gravar o Grub no dispositivo que pretende manter, e não vai formatar.
Faça, no terminal:
sudo grub-install /dev/sdX
sudo update-grub
Observe que X deve ser substituído pela letra identificadora do dispositivo que deve conter o Grub.
Terceiro, pode reiniciar o Sistema e verificar se que vai iniciar pelo dispositivo desejado.
Quarto, abra o Gparted e formate o dispositivo que não pretende manter.
Quinto, para que o Grub não mostre o Sistema que já foi formatado, basta atualizar:
sudo update-grub
Nota, deve digitar a senha depois de comandos `sudo`, sempre que solicitado.
Nota 2, o Gparted vai solicitar senha para ser aberto.