Vou te dizer o que eu faço, eu tenho meus sistemas em dual boot com o Windows 8, tanto no Pc quanto no Notebook. No caso do Notebook que só tem 1 HD, tenho o meu sistema Linux com todas as suas partições em sistema de arquivos nativo do Linux. Eu acesso a partição NTFS do Windows para ler ou gravar alguma coisa, como por exemplo, se eu baixo algum arquivo .exe pelo Linux e depois copio ou recorto este arquivo para partição NTFS do Windows 8. O Linux "vê " as partições do Windows mas o contrário não é verdadeiro.
Isto por padrão, pois tem um programa pago para fazer o Windows ver e gravar nas partições do Linux. Eu nunca usei.
Pode criar sua /home com sistema de arquivos do Linux e depois o que precisar ler ou gravar no Windows você passa pra ele pelo Linux mesmo, se der alguma caca no NTFS do Windows, só dar o boot pelo Windows e concertar o problema.