Nossa pessoal, muito obrigado pela ajuda.
Eu na verdade não estou muito preocupado com backup, pois o máximo que iria acontecer era eu perder a partição raiz, e ter que reinstalar o sistema de qualquer jeito. Eu sei que existe a possibilidade do gparted ferrar com tudo sem querer, inclusive minha home, mas eu tenho cópia dos meus arquivos principais no Ubuntu One pelo menos.
Vou inciar o ubuntu pelo pendrive, abrir o gparted e fazer como vocẽs comentaram: redimensionar a home, criar uma nova partição idêntica, e mandar copiar.
Depois edito o fstab e recupero o grub.
Eu também sempre tive dúvidas sobre esse aspecto de estar no começo ou final do HD. Eu sempre tive minhas partições de sistema no início do HD (ou, pelo menos, no início do mapa no gparted), e o desempenho sempre foi dentro do esperado. Esse iria ser o teste para verificar se melhora ou não. Acho que piorar não vai (pois senão seria inutilizável), mas se ficar muito ruim eu tiro tudo e particiono do jeito certo de uma vez.
Vou fazer isso agora e mais tarde posto os resultados
Valeu!
[Edit]
Perfeito, deu tudo certo. O gparted levou uma eternidade para copiar a partição, e no fim ainda sobrou um espaço não alocado de 1MB entre a partição do Windows e a minha home (não entendi o motivo, mas deixei assim mesmo já que deu tudo certo). Foi necessário apenas restaurar o grub e está tudo funcionando bem.
Valeu gente.