Olá Sérgio! Boa Noite!
Obrigado pela resposta. Até entendo que possa ser isso, mas, algumas janelas, ao serem iniciadas são maximizadas ocupando 2 espaços. E, então, quando você está em um deles (que, por exemplo, foi escolhido para o Fire Fox com outras 4 janelas) você alterna (com ALT-TAB) e lá está ela. Ou então, quando você muda para outro, a parte de baixo da janela de cima "tampa" parte do painel superior. Eu acho isso chato e não achei uma configuração que permita que cada janela fique eu seu próprio espaço, como no Gnome. Para mim o Unity está sendo excelente, menos neste aspecto.
Outra coisa que me chateia demais é quando estamos navegando e, então, abra-se um pop-up; contudo, a "imagem" dele está em nossa frente, mas a barra de título que a representa está atrás. Resultado: quando se tenta fechá-la, fecha-se, na verdade a janela que está encondia atrás (a janela original na qual estamos trabalhando ou navegando).
São pequenos detalhes que diminuem muito a produtividade. Já nos basta o CSSM que é bem chato de configurar e que temos que ir meio que "adivinhando" o que vai ser feito.
No mais, vamos ver se os desenvolvedores mudam um pouco isto (espero).