Para instalar aplicativos com formato .bin, basta dar-lhe permissão de execução:
sudo chmod +x Aplicativo.bin
E chama-lo novamente, para a execução:
./Aplicativo.bin
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Não se recomenda a instalação do Ubuntu 8.10 (por hora), por ainda não estar em sua versão atual (podendo sofrer falhas, bugs e etc...). Mais se mesmo assim tiver interesse em instalar, basta lhe reservar uma partição, baixar o CD, dar boot com ele e selecionar a instalação normalmente, no momento que surge o particionador (muito cuidado e atenção), selecione a partição que você determinou a ele.
Se quiser compartilhar alguma partição, exemplo, SWAP, basta clicar em Editar Partição e seleciona-la como Partição de Troca SWAP, e não formata-la. O mesmo para partições com /home. Monte-a como /home, mais não marque o "checkbox" para formata-la.
Boa sorte!